Die Gesellschaft geht zurück auf die 1983 von Prof. Revers, Prof. Tellenbach und Prof. Wyss gegründete „Deutsche Gesellschaft für anthropologische und daseinsanalytische Medizin, Psychologie und Psychotherapie“ (DGA). Ihr Sitz war bis 2012 in Würzburg, erste Vorsitzende waren Prof. Dieter Wyss, dann Prof. Hermann Lang und schließlich Prof. Thomas Fuchs.
2013 befindet sich die Gesellschaft unter ihrem jetzigen Namen als DGAP in Umgründung. Ihren Sitz verlegte sie nach Heidelberg, wo sie nun organisatorisch der Sektion “Phänomenologische Psychopathologie” (Leitung Prof. Fuchs) zugeordnet ist.